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分子生物学虚拟仿真系统购置(JJ22000755)采购公告
辽宁 沈阳
2022-11-05
收藏标讯
基本信息
招标单位：
东北大学
公告正文
分子生物学虚拟仿真系统购置（***）采购公告
| 项目名称 | 分子生物学虚拟仿真系统购置 | 项目编号 | *** |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | ***-***-05 09:10:04 | 公告截止日期 | ***-***-09 09:00:00 |
| 采购单位 | 东北大学 | 付款方式 | 【贴息贷款项目专用】货物安装调试完成并经甲方验收合格后支付全部款项。 |
| 联系人 | 登录后可见 | 联系电话 | 登录后可见 |
| 签约时间要求 | 成交后1天 | 到货时间要求 | 签约后***天 |
| 预算总价 | ￥ *** + NaN + NaN | ||
| 发票要求 | 增值税普通发票 增值税专用发票 | ||
| 含税要求 | |||
| 送货要求 | |||
| 安装要求 | |||
| 收货地址 | 辽宁省沈阳市浑南区创新路195号 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 公告说明 | |||
采购清单 1
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 分子生物学虚拟仿真系统 | 8 | 套 | 办公软件 无 无 |
| 品牌 品牌1 | 南京莱医特 |
|---|---|
| 型号 | 按参数定制 |
| 品牌2 | |
| 型号 | |
| 品牌3 | |
| 型号 | |
| 预算单价 | ￥ *** |
| 技术参数及配置要求 | 【贴息贷款项目专用】违约责任: 供应商参与报价即认为完全同意以下全部内容。本项目需要使用学校专用合同范本，以下均称项目中购置物资为“本合同产品”，称供应商为乙方。鉴于在本合同产品采购过程中，乙方已清楚了解，甲方采购本合同产品的资金来源为财政贴息贷款，贷款支付条件即甲方向乙方的付款条件为签订书面合同。同时，该贷款享受两年年息***个百分点的财政贴息，而办理财政贴息的条件为作为产品采购款的贷款在***年底前已支付且乙方已提供全额合法有效发票。 如乙方未按期向甲方提供发票导致甲方未享受财政贴息的，乙方应向赔偿甲方本合同采购款为基数的两年财政贴息损失。如因乙方未按约定提供发票导致贷款行收回贷款的，甲方有权解除合同，乙方应返还甲方已支付的合同款，并向甲方支付合同金额20%的违约金。一、项目描述本产品运用3D虚拟仿真技术，现代三维图形图像技术，把枯燥的书本讲解变成鲜活的模型，它以最新的虚拟现实信息技术为依托，以3D交互体验、互动性为手段，依据符合国家关于信息化系统建设的标准规范开发完成的虚拟现实仿真系统。通过三维化实现虚拟仿真实验基于聚合酶链反应技术的仿真过程，让学生可以通过虚拟操作完成整个实验步骤，达到人机互动的实验效果帮。帮助学生快速掌握常规PCR、外周血DNA提取、逆转录等操作。虚拟实验项目画面运行流畅，逼真的虚拟场景将让您可以切身感受体验其中身临其境的奇妙过程。本软件做到融实用性、教育性、娱乐性和趣味性为一体的教学方式，要求学生通过在计算机上的操作来学到相关专业技能和知识，系统既好玩、又有趣，还能“涨知识”，提高学生学习兴趣。学生可以虚实结合，反复训练和加强记忆，从而提高学生创新思维及实操技能能力。二、项目总体要求***、技术要求：系统采用B/S架构；PC端支持win***、win10在内的主流操作系统；软件运行稳定，安全性高。***、设备配置要求：系统可流畅运行于CPU不低于i5、内存不低于4G、拥有2G以上独立显卡的台式或笔记本电脑上。三、系统性能1、稳定性：系统出厂前采用回归测试、功能测试、压力测试、负载测试、性能测试、易用性测试、安装与反安装测试、回复测试、安全性测试、兼容性测试、内存泄漏测试、比较测试Alpha测试和Beta测试。要求系统能够长时间运行稳定，具有较高的系统稳定性。2、安全性：必须保证系统的安全性，有效解决安全漏洞问题，同时要具有对开发中发现的安全漏洞有进一步的改进和完善的功能，以确保系统安全、可靠，不具有、不传播恶性、破坏性、攻击性的程序代码，自身不易受到外部恶性程序攻击，不具有明显漏洞。3、流畅性：确保系统展示时过程流畅，平滑连续，响应及时。4、易用性和友好性：系统内嵌提醒帮助机制，在各个子界面中，设计文本提示框等信息。软件采用面向对象设计，操作者通过对话框、菜单等简便的操作，能够对软件进行应用；U I界面设计：菜单栏、视图窗口、属性窗口、对话框，满足虚拟实验管理和操作的需要。四、系统设计规范（1）GB8566-88《计算机软件开发规范》（2）GB856***-88《计算机软件产品开发文件编制指南》（3）GB9385-88《计算机软件需求说明编制指南》（4）GB9386-88《计算机软件测试文件编制规范》（5）GB/T28035-20***《软件系统验收规范》五、虚拟仿真实验开发内容：8套软件，除基础知识部分之外，每套包分别包含操作部分的项目之一***基础知识发展历程聚合酶链反应( polymerasechainreaction PCR )是20世纪80年代中期发展起来的一种体外核酸扩增技术。PCR技术利用针对目的基因所设计的一-对特异性寡核苷酸引物，以目的基因为模板，在体外合成DNA片段。能在数小时内将所要研究的目的基因或DNA片段扩增数十万乃至百万倍，具有特异、敏感、高效、简便、重复性好、易自动化等突出优点，这项技术极大地推动了生命科学的研究进展，被誉为20世纪分子生物学研究领域最重大的发明之一，其发明者KaryMullis也因此获得了1993年度诺贝尔化学奖。目前PCR技术已广泛应用于临床分子生物学检验的各个领域。基本原理1)PCR技术基本原理2)PCR反应动力学反应体系1)模板2)引物3)脱氧核苷三磷酸4)DNA聚合酶5)缓冲液扩增条件1)温度2)时间3)循环次数4)优化扩增条件的PCR技术产物分析1)概述2)凝胶电泳分析3)PCR产物的酶切分析4)PCR-单链构象多态性分析5)核算探针杂交分析6)熔点曲线分析***)测序分析常见问题1)假阳性2)假阴性3)引物二聚体4)非特异性扩增5)出现片状拖带或涂抹带衍生技术1)巢式PCR2)序列特异PCR3)逆转录PCR4)多重PCR5)转录依赖扩增系统6)随机引物PCR***)全基因组扩增8)微乳液扩增9)锚定扩增10)长片段PCR***)甲基化特异性PCR12)重组PCR名词解释指在实时荧光PCR扩增过程中，对整个PCR反应扩增过程进行了实时的监测和连续地分析扩增相关的荧光信号，随着反应时间的进行，监测到的荧光信号的变化可以绘制成一条以循环数为横坐标，以PCR反应过程中实时荧光强度为纵坐标所做的曲线。2、实际操作部分1)常规PCR请选择合适的移液器量取***μL 10x ExTaq buffer请取合适的枪头请用移液器吸取25yC10 *ExTaq buffer请将吸取的10x ExTaq buffer加入到PCR管中请将枪头丢进废液缸请调节移液器量程至***.yL请取合适的枪头请用移液器吸取***μL20 mM F请将吸取的20 mM F加入到PCR管中请将枪头丢进废液缸向PCR管中加入***μ L下游引物(20 mM R)请先选择合适的移液器吸取***μL下游引物请调节移液器量程至***yL请取合适的枪头请用移液器吸取***μL下游弓|物(20 mM R)请将吸取的下游弓|物(20 mM R)加入到PCR管中请将枪头丢进废液缸向PCR管中加入***pLE T aq酶，请先选择合适的移液器吸取***μL ExTaq酶请用移液器吸取***μLExTaq酶请将枪头丢进废液缸向PCR管中加入2仙业dNTP请先选择合适的移液器吸取2μL dNTP向PCR管中加入适量dGH2O请先选择合适的移液器吸取适量ddH2O至反应体系为25 μL请厢移液器吸杈适量ddIH2O，使反应体系为25 pL请将吸取的ddH2C加入到PCR管中请将枪头丢进废液缸将反应体系PCR管放入PCR仪进行扩增设置参数，start2)分光光度法检测核算的浓度和纯度请调试紫外分光光度计使用前请先擦拭仪器用移液器吸取2微升蒸馏水点样操作紫外分光光定仪，清零用移液器吸取2微升蒸馏水点样操作紫外分光光定仪，测试蒸馏水用移液器吸取2微升样品溶液进行测定操作紫外分光光定仪，测试样品溶液3)DNA的限制性内切酶酶切反应加入15μ LDNA加入3 μ L 10xBuffer加入3μL酶加入9μL ddH2O点击【振荡器】EP管置于振荡器上震荡混匀点击【干式恒温器】，设置酶切条件: 3*** C孵育2h4)琼脂糖凝胶电泳取出制胶槽，并插上样孔梳点击[琼脂糖]用药勺取出少量放到称量纸上，直到电子天平数值显约示***00g点步[1 x TAE缓冲液试剂瓶]，盖子打开，用小量简量取TAE缓冲液100mL倒入三角烧瓶，混匀点击[微波炉]，放入三角烧瓶，加热直至琼脂糖全部熔化冷却至60°C后，点击[ gelred荧光染料]，盖子打开，用移液枪取5 μ加入三角烧瓶中，混匀。将琼脂糖凝胶趁热倒入制胶槽，达3- -5 mm厚，水平静置40 min让其完全凝固。将凝胶随托架起放入加有足量的 1 X TAE缓冲液电泳槽中( 缓冲液浸没过凝胶面2-3 mm)，小心拔出样孔梳。取5μ L PCR产物放入EP管中取1 μL 6x .上样缓冲液放入EP管中。取EP管中的液体进行点样以靠近上样端接负极，另端接正极，接通电源，以120 v的电压电泳30 min。电泳结束后，取出凝胶放入凝胶成像系统成像室，并照相记录结果。5)变性琼脂糖凝胶电泳配置琼脂糖量取5X甲醛凝胶电泳缓冲液量取DEPC处理过的双蒸水将配置好的锥形瓶置于微波炉中溶胶吸取SuperRed溶液量取甲醛溶液制作凝胶吸取RNA溶液吸取5X甲醛凝胶电泳缓冲液吸取甲醛溶液吸取甲酰胺溶液将EP管放置于干式恒温器中将EP管立即置于冰盒中冰浴冷却将EP管进行瞬时离心将EP取出放回EP管架吸取2 μ L灭菌的DEPC处理的甲醛凝胶加样缓冲液预电泳电泳将凝胶转入凝胶成像系统照相6)聚丙烯酰胺凝胶电泳（硝酸银染色）取5μL DNA和30μL变性上样缓冲液配置样品依次向空烧杯中加入DDH2O 29mL 30%凝胶贮存液5mL缓冲液( pH*** ) 6mL10%过硫酸铵100μL制胶给上样孔.上样以200 v的电压电泳5 min凝胶板剥离加入固定液( 10%乙醇)，固定10分钟加入1%硝酸，振摇4min水洗2次加入***%硝酸银，染色20分钟，水洗3次加入新鲜配制的显色液，显色***)逆转录超净工作台灭菌用移液器量取适量RNase Free dHO加入到pcr管1配置基因组DNA的除去反应缓冲液，用移液器 量取***μL 5 x gDNA EraserBuffer加入到pcr管1中用移液器量取***0 μL gDNA_ Eraser 加入到pcr管1中用移液器吸取适量RNA (根据检测到的RNA浓度来配置)，加到pcr管1中中反复吹吸混匀用移液器量取适量RNase Free dHO加入到pcr管2中配置反转录反应缓冲液，用移液器量取***μ L5 x PrimeScript@ Buffer 加入到pcr管2中用移液器量取***0 μ L PrimeScript@_ RT_ Enzyme_ _Mix-I 加入到pcr管2中用移液器量取***0μL RT_ Primer_ Mix 加入到pcr管2中用移液器从pcr管1中量取***μL反应液，加入到pcr管2中将pcr管2放在在PCR仪.上进行反转录反应将得到的cDNA存放在20°C 冰箱保存待用8)实时荧光定量PCR--染料法超净台灭菌吸取10 μL标准品质粒( Actin)加入90 μL稀释液(1x10)中吸取10μL稀释液( 1x10)加入90μL稀释液(1x10)中吸取10μL稀释液( 1x10)加入90μL稀释液(1x10)中吸取10μL稀释液( 1x10)加入90μL稀释液(1x10④)中吸取10μL稀释液( 1x104)加入90μL稀释液(1x10③)中吸取10μL稀释液( 1x103)加入90 μ L稀释液( 1x10②)中(按照此表配置3种质粒DNA的梯度稀释标准品)向离心管中加入228μL水向离心管中加入6μL上游引物(Actin)向离心管中加入6 μL下游引物(Actin)向离心管中加入300μL mix加完后震荡混匀放入离心机中离心将反应体系分装到29个荧光定量PCR管中( 配制其它两种DNA的反应体系，分别分装到29个荧光定量PCR管中)分别加入2 μL阴性对照到2个荧光定量PCR管中分别加入2 μ L Actin样品到右侧9个荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10)到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10 )到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10 )到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10 ④)到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10③ )到右侧荧光定量PCR管中加入2 μL稀释液(1x10②)到右侧荧光定量PCR管中( 按照此表向体系中加入对应DNA )将荧光定量PCR管放入离心机中离心将荧光定量PCR管放入荧光定量PCR仪中，然后软件操作9)实时荧光定量PCR--探针法超净台灭菌吸取10 μL标准品质粒( Actin)加入90 μL稀释液(1x10)中吸取10μL稀释液( 1x10)加入90μL稀释液(1x10)中吸取10μL稀释液( 1x10)加入90μL稀释液(1x10)中吸取10μL稀释液( 1x10)加入90μL稀释液(1x10④)中吸取10μL稀释液( 1x104)加入90μL稀释液(1x10③)中吸取10μL稀释液( 1x103)加入90 μ L稀释液( 1x10②)中(按照此表配置3种质粒DNA的梯度稀释标准品)向离心管中加入198μL水向离心管中加入18μL上游引物(Actin)向离心管中加入18μL下游引物(Actin)向离心管中加入300μL mix和6μL探针加完后震荡混匀放入离心机中离心将反应体系分装到29个荧光定量PCR管中( 配制其它两种DNA的反应体系，分别分装到29个荧光定量PCR管中)分别加入2 μL阴性对照到2个荧光定量PCR管中分别加入2 μ L Actin样品到右侧9个荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10)到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10 )到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10 )到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10 ④)到右侧荧光定量PCR管中加入2μL稀释液( 1x10③ )到右侧荧光定量PCR管中加入2 μL稀释液(1x10②)到右侧荧光定量PCR管中( 按照此表向体系中加入对应DNA )将荧光定量PCR管放入离心机中离心将荧光定量PCR管放入荧光定量PCR仪中，然后软件操作***拓展基地1)自测题库2)引物设计3)基因诊断室介绍4)荧光定量PCR***综合实验1)PCR-SSCP检测凝血因子V基因突变向空试管中加入1ml生理盐水再向该试管中加入1ml外周血血液向新的空试管中加入1ml淋巴细胞分离液用一次性滴管把所有的稀释的血吸出，加入到淋巴细胞分离液的试管中配平后放入离心机中离心用移液器( 黄色100微升)吸弃上层黄色的再用移液器( 白色10微升)吸取单个核细胞，加入到新的空试管中次性滴管取生理盐水加入到该试管中，一直加到生理盐水离管口2cml处轻摇之后离心，2000rpm 15分钟用移液器(黄色100微升)吸弃上层清液加200微升生理盐水移液器轻柔吹打混匀后转入离心管配平后2000rpm离心15分钟吸弃上清，留细胞沉淀于EP管中用作下一步RNA或DNA提取2)多重PCR检测α-地中海贫血基因缺失向空试管中加入1ml生理盐水再向该试管中加入1ml外周血血液向新的空试管中加入1ml淋巴细胞分离液用一次性滴管把所有的稀释的血吸出，加入到淋巴细胞分离液的试管中配平后放入离心机中离心用移液器(黄色100微升)吸弃上层黄色的再用移液器(白色10微升)吸取单个核细胞，加入到新的空试管中用一次性滴管取生理盐水加入到该试管中，一直加到生理盐水离管口2cml处轻摇之后离心，2000rpm 15分钟用移液器( 黄色100微升)吸弃上层清液加200微升生理盐水移液器轻柔吹打混匀后转入离心管配平后2000rpm离心15分钟吸弃上清，留细胞沉淀于EP管中用作下一-步RNA或DNA提取3)等位基因特异性PCR分析CYP2C9基因多态性向空试管中加入1ml生理盐水再向该试管中加入1ml外周血血液向新的空试管中加入1ml淋巴细胞分离液用一次性滴管把所有的稀释的血吸出，加入到淋巴细胞分离液的试管中配平后放入离心机中离心用移液器(黄色100微升)吸弃上层黄色的再用移液器(白色10微升)吸取单个核细胞，加入到新的空试管中用一次性滴管取生理盐水加入到该试管中，一直加到生理盐水离管口2cml处轻摇之后离心，2000rpm 15分钟用移液器( 黄色100微升)吸弃上层清液加200微升生理盐水移液器轻柔吹打混匀后转入离心管配平后2000rpm离心15分钟吸弃上清，留细胞沉淀于EP管中用作下一-步RNA或DNA提取4)RT-PCR分析FGF的mRNA表达水平向空试管中加入1ml生理盐水再向该试管中加入1ml外周血血液向新的空试管中加入1ml淋巴细胞分离液用一次性滴管把所有的稀释的血吸出，加入到淋巴细胞分离液的试管中配平后放入离心机中离心用移液器(黄色100微升)吸弃上层黄色的再用移液器(白色10微升)吸取单个核细胞，加入到新的空试管中用一次性滴管取生理盐水加入到该试管中，一直加到生理盐水离管口2cml处轻摇之后离心，2000rpm 15分钟用移液器( 黄色100微升)吸弃上层清液加200微升生理盐水移液器轻柔吹打混匀后转入离心管配平后2000rpm离心15分钟吸弃上清，留细胞沉淀于EP管中用作下一-步RNA或DNA提取5)长片段PCR扩增人β珠蛋白基因序列向空试管中加入1ml生理盐水再向该试管中加入1ml外周血血液向新的空试管中加入1ml淋巴细胞分离液用一次性滴管把所有的稀释的血吸出，加入到淋巴细胞分离液的试管中配平后放入离心机中离心用移液器(黄色100微升)吸弃上层黄色的再用移液器(白色10微升)吸取单个核细胞，加入到新的空试管中用一次性滴管取生理盐水加入到该试管中，一直加到生理盐水离管口2cml处轻摇之后离心，2000rpm 15分钟用移液器( 黄色100微升)吸弃上层清液加200微升生理盐水移液器轻柔吹打混匀后转入离心管配平后2000rpm离心15分钟吸弃上清，留细胞沉淀于EP管中用作下一-步RNA或DNA提取6)实时荧光定量PCR（染料法）检测IL1Beta-mRNA向空试管中加入1ml生理盐水再向该试管中加入1ml外周血血液向新的空试管中加入1ml淋巴细胞分离液用一次性滴管把所有的稀释的血吸出，加入到淋巴细胞分离液的试管中配平后放入离心机中离心用移液器(黄色100微升)吸弃上层黄色的再用移液器(白色10微升)吸取单个核细胞，加入到新的空试管中用一次性滴管取生理盐水加入到该试管中，一直加到生理盐水离管口2cml处轻摇之后离心，2000rpm 15分钟用移液器( 黄色100微升)吸弃上层清液加200微升生理盐水移液器轻柔吹打混匀后转入离心管配平后2000rpm离心15分钟吸弃上清，留细胞沉淀于EP管中用作下一-步RNA或DNA提取六、其他要求：因项目属性原因，时间紧迫，全流程按照采购系统约定执行并签署合同，因供应商原因导致项目资金无法在12月31日前支付给供应商，从而未获得财政贴息的，由供应商承担。 |
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